Natalie Robinson
  • Welcome
  • Research
  • Technical Skills
  • CV
Download as PDF
Natalie Robinson 
Boulder, CO   
  ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
EDUCATION
    PhD. University of Colorado, Boulder. Advisors: M. Deane Bowers, Robert Guralnick                                                                                                               2013
            Department of Ecology and Evolutionary Biology                                                                                                                                                            
    M.A. University of Colorado, Boulder.  Advisor: M. Deane Bowers                                                                                                                                                    2009 
            Department of Ecology and Evolutionary Biology
    B.S. University of California, Berkeley. 
             Major: Molecular Environmental Biology                                                                                                                                                                                               2003  
    
​    Continuing Education and Certifications
            Epic React                                                                                                                                                                                                                                                     Current           
            
Udemy - Machine Learning A-Z (partially completed)                                                                                                                                                                      2020
            Compass Science Communications Workshop                                                                                                                                                                                    2017
            Software/Data Carpentry Certified Instructor                                                                                                                                                                                      2014
            Bayesian Modeling for Practicing Ecologists                                                                                                                                                                                          2014
_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
RESEARCH INTERESTS & SKILLS
            Data Engineering, Management, Visualization                                 Python, R, Javascript, React                                                            Ecological Modeling                   
            Bayesian & Frequentist Statistical Analysis                                      Git/Github                                                                                            Community Ecology
            Mobile Application Development                                                         Markdown, SQL, HTML                                                                  Scientific Writing
            Spatial Data Processing & Analyses                                                     GIS Modeling Applications                                                             Spatial Ecology

_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
PROFESSIONAL EXPERIENCE

    Earthshot Labs                                                                                                                                                                                                                                         2022-Present
          Data Engineer
                Fullstack engineering: development of backend data processing workflows and automated tests (Python), and
                       frontend design (React)
                Geospatial data processing (Google Earth Engine and Python libraries) and visualization
                 Development and maintenance of NoSQL databases (MongoDB)
                 Support of cross-team data engineering efforts - database development, data processing workflows, etc. Support
                             of automated report generation
        
    National Ecological Observatory Network (NEON)                                                                                                                                                                        2014-2022                        
                Data Scientist II & Scientific Software Developer                
                Development and implementation data QA/QC algorithms and tools for staff use
                 Development of mobile data collection applications
                 Assistance with spatial data processing and workflow improvement
                 Development and implementation of observatory commissioning tests, and report generation                                                                 
                 Outreach to scientific community through conference & workshop attendance/teaching
                 Contribution of lesson materials/coding support to ‘NEON Data Skills’ website
                 General support to science staff for technical document writing, statistical analyses, data acquisition and management,
                          development and use of scripting tools (R, Python, Javascript) for various workflows

_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
RESEARCH EXPERIENCE
    Understanding the drivers of butterfly diversity patterns and testing model transferability                                                                                              2009-2013
                  across global ecosystems
                  Dissertation research, with M. Deane Bowers and Robert Guralnick                                            
                  Department of Ecology and Evolutionary Biology; University of Colorado, Boulder                             
    Graduate Research Assistant: Modeling variables of importance to the distributions of                                                                                                      2011-2013
                  organisms on a global scale (with NCEAS); integrating global species distributions, remote        
                  sensing and climate data to assess biodiversity response to climate change (with NASA
                  Climate and Biological Response program), with Robert Guralnick
                  Department of Ecology and Evolutionary Biology; University of Colorado, Boulder                
    Research Data Analyst: Statistical analyses on various research projects,                                                                                                                                  2010-2012
                  using R statistical software, with Michael Grant                                                                                                                          
                  Department of Ecology and Evolutionary Biology; University of Colorado, Boulder    
    Monitoring the effects of habitat type and land-use variables on butterfly communities:                                                                                                  2006-2009
                  Master’s Research, with M. Deane Bowers       
                  Department of Ecology and Evolutionary Biology; University of Colorado, Boulder                                        
     Graduate Research Assistant: Museum collection reorganization and improvement: insect                                                                                                      2008 
                  teaching collection, with M. Deane Bowers                                          
                  Department of Ecology and Evolutionary Biology; University of Colorado, Boulder                            
     Research Assistant: Small mammal disease dynamics and population ecology, with Sharon Collinge                                                                                   2004  
                  Department of Ecology and Evolutionary Biology; University of Colorado, Boulder                                          
     Lab Assistant II: Amphibian parasite and fungal pathogen ecology, with Cheryl Briggs                                                                                                               2003
                  Department of Integrative Biology; University of California, Berkeley                                                 
     Lab Assistant II: Gall making insect and parisatoid population ecology, with Cheryl Briggs                                                                                            2002-2003
                  Department of Integrative Biology; University of California, Berkeley                                                                 
     Field Asssistant II: Invasion dynamics in a California grassland ecosystem, with Jeffrey Corbin                                                                                               2002
                  Department of Integrative Biology; University of California, Berkeley  
     The effects of invasive species on insect communities in a California grassland ecosystem.                                                                                             2002-2003
                  Undergraduate research with Jeffrey Corbin
                  Department of Integrative Biology; University of California, Berkeley                                                                
_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
PUBLICATIONS

    Peer-reviewd
           Li, D., Record, S., Sokol, E., Bitters, M., Chen, M., Chung, A., Helmus, M., Jaimes, R., Jansen, L.,
                    Jarzyna, M., Just, M., LaMontagne, J., Melbourne, B., Moss, W., Norman, K., Parker, S.,
                    Robinson, N., Seyednasrollah, B., Smith, C., Spaulding, S., Surasinghe, T., Thomsen, S.,
                    Zarnetske, P. NEON organismal data for biodiversity research. Ecosphere. 2022, 13(7), e4141.
                    
doi: 10.1002/ecs2.4141
 
         Robinson, N., Barnett, D.T., Jones, K. D., Stanish, L. F., Parker, S. M. Multiple dimensions of
                    resilience: How NEON supports ecology and community in the face of compounding disasters.
                    Frontiers in Environmental Science. 2022, 10, 144. doi: 10.3389/fenvs.2022.653666

         Parmentier, B., McGill, B., Wilson, A., Regetz, J., Jetz, W., Guralnick, R., Tuanmu, M-N., Robinson N.,
                    Schildhauer, M. An assessment of methods and remote-sensing derived covariates for regional 
                    predictions of 1 km daily maximum air temperature. Remote Sensing. 2014, 6(9), 8639 - 8670.
                   
doi: 10.3390/rs6098639

          Robinson N., Kadlec, T., Guralnick, R. P., Bowers, M. D. 2014. Integrating species traits
                   and habitat characteristics into models of butterfly diversity in a fragmented ecosystem. 
                   Ecological Modelling. 281(10): 15-25.  
doi: 10.1016/j.ecolmodel.2014.01.022

           Robinson N., Regetz, J,. Guralnick, R. P. 2014. EARTHENV-DEM90: A Nearly-global, void-free,
              multi-scale smoothed, 90m digital elevation model from fused ASTER AND SRTM data. In 
                    review, ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing, 87(2014): 57-67.
                    d
oi: 10.1016/j.isprsjprs.2013.11.002

          Robinson N., Armstead, S and Bowers, M.D. 2012. Butterfly Community Ecology: The 
                    Influences of Habitat Type, Weather Patterns and Dominant Species in a Temperate
                    Ecosystem. Entomologia. 145(1)   

           Basey, J. M., Sackett, L. C., Robinson N. 2008. Optimal Science Lab Design:  impacts of various
                     Components of lab design on students’ attitudes toward lab. International Journal for the
                     Scholarship of Teaching and Learning, 2 (1)

    Non Peer-reviewed   
          Robinson N., Barton, K., Nufio, C., Bowers, M.D.  2010. Laboratory Manual for Insect Biology,
                    University of Colorado, Boulder. 
_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
DATA PUBLICATIONS
    Dryad
            Robinson N, Armstead S, Bowers MD (2012) Data from: Butterfly community ecology: the
                   influences of habitat type, weather patterns, and dominant species in a temperate
                   ecosystem. Dryad Digital Repository. doi:10.5061/dryad.57vh3
_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
GRANTS, AWARDS & FELLOWSHIPS                                                                                        
   
Battelle Outstanding Performance Award                                                                                                                                                                                                  Sep 2020        
         
$1000
    Battelle Outstanding Performance Award                                                                                                                                                                                                Apr 2020
         $1000

    InnoCentive                                                                                                                                                                                                                                                          Sep 2017
                    Challenge #9933881- DataApp: A Mobile App Framework for Field Data Capture – Stage 1. $2500                                                                                                            
    University of Colorado Graduate School                                                                                                                                                                                                   Fall 2013
                     Dissertation Completion Fellowship. $9,879.82                                                                            
    Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Colorado, Boulder                                                                                                                Fall 2013
                     Dissertation Completion Fellowship. $9,879.82    
     University of Colorado Graduate School                                                                                                                                                                                                 May 2012
                   Travel grant to present research at the 97th Annual Ecological Society of America Meetings. $300                                                                   
     Ecology and Evolutionary Biology Departmental Grant, University of Colorado, Boulder                                                                                                April 2012                       
                   Understanding the Influence of Habitat Fragmentation on Butterfly Occurrence Patterns: Developing and
                   Testing Models Across Global Ecosystems. $2000                                                                                                                                                                 
    Beverly Sears Graduate Student Grant, University of Colorado, Boulder                                                                                                                                  April 2012
                   Understanding the Influence of Habitat Fragmentation on Butterfly Occurrence Patterns: Developing and 
                   Testing Models Across Global Ecosystems. $1000                                                                                                                                                                  
    Ecology and Evolutionary Biology Departmental Grant, University of Colorado, Boulder                                                                                                   May 2010
              Species Trait Modeling of Butterflies in Urban Fragments Along the Colorado Front Range: $750                                                                         
    Ecology and Evolutionary Biology Departmental Grant, University of Colorado, Boulder                                                                                                April 2009 
                   Species Trait Modeling of Butterflies in Urban Fragments Along the Colorado Front Range: $1500                                                                
    University of Colorado Museum of Natural History Grant, University of Colorado, Boulder                                                                                          April 2009
                   Species Trait Modeling of Butterflies in Urban Fragments Along the Colorado Front Range: $1200                                                               
     Ecology and Evolutionary Biology Spring Symposium, University of Colorado, Boulder                                                                                                    May 2008
            Best Graduate Student Talk 
     Ecology and Evolutionary Biology Departmental Grant, University of Colorado, Boulder                                                                                               April 2008
                   Long-term Survey of Butterfly Communities on City of Boulder OSMP Land: $840                                                                                             
     City of Boulder Open Space and Mountain Parks Research Grant                                                                                                                                               May 2007
                   Long-term Survey of Butterfly  Communities on City of Boulder OSMP Land: $6,235                                                                                                                                   
     Ecology and Evolutionary Biology Departmental Grant, University of Colorado, Boulder                                                                                               April 2007
                   Long-term Survey of Butterfly Communities on City of Boulder OSMP Land: $750                                                                                              
_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
INVITED TALKS
    Robinson Natalie. 2008. (Talk) “Long-term Monitoring of Butterfly Communities around City of Boulder
                    Open Space and Mountain Parks Land.” Boulder County Audubon Society “Butterfly Night” meeting. 
    Robinson Natalie. 2011. (Talk) “Butterfly Community Variation in Urban Fragments of the Colorado
                   Front Range.” City of Louisville, CO Open Space Advisory Board Meeting.
_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
PRESENTATIONS
    Robinson, Natalie. 2017 (Talk) “Quality is everything: Automated data collection tools to enhance the quality of NEON's 'big data' streams.”
                    Ecological Society of America Annual Meeting
    Robinson, Natalie. 2012. (Talk) “Methods for constructing a high quality 90m Global DEM.” University of 
                   Colorado Brown Bag Series.
    Robinson, Natalie. 2012. (Poster) “Understanding community response to habitat fragmentation: 
                    Modeling butterflies across global ecosystems.” 
Ecological Society of America Annual Meeting
                    F1000 poster: http://f1000.com/posters/browse/summary/1092599.
    Robinson Natalie. 2010. (Talk) “The Orange Skipperling (Copaeodes aurantiaca (Hesperiidae)): A New 
                    Record for the Colorado Front Range.” 21st Annual Meeting of the High Country Lepidopterists Society.            
    Robinson Natalie. 2010. (Talk) “To Be or Not To Be: Using Ecological Modeling to Understand 
                    Butterfly Occurrence Patterns Based on Species Traits and Environmental Variables.” University of 
                    Colorado Museum Award Recipients Lunch-time Presentation Series.              
    Robinson Natalie. 2009. (Talk) “To Be or Not To Be: Using Ecological Modeling to Understand 
                    Butterfly Occurrence Patterns Based on Species Traits and Environmental Variables.” Guild for the 
                    Rocky Mountain Ecologists and Evolutionary Biologists Annual Meeting.
    Robinson Natalie. 2008. (Talk) “The Effects of Environmental and Land-use Variables on Butterfly
                    Communities Across a Temperate Landscape.” University of Colorado Department of Ecology and 
                    Evolutionary Biology Spring Symposium
    Robinson Natalie. 2007. (Talk) “City of Boulder Open Space and Mountain Parks Butterfly Survey.” 18th 
                    annual High Country Lepidopterists Meeting.
_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
TEACHING/MENTORING EXPERIENCE
        Ecological Society of America Workshop: “Working with Biodiversity Data                                                                                                                  Summer 2020
               Instructor – R for data processing and visualization of NEON  
        NEON Internship Program                                                                                                                                                                                                                       2019 - 2020
               Mentor for internship project to build R Shiny applications for various use cases
                     within the organization. Support of data acquisition from databases and APIs
                     and reformatting via LaTex for high-quality downloadable csvs and pdfs 
        Explore NEON Workshop: Virginia Commonwealth University                                                                                                                                                  Fall 2019
               Instructor – Introduction to NEON, basics of getting and working with NEON data in R 
        NEON Summer Internship Program                                                                                                                                                                                                Summer 2019
               Co-mentor for internship project “A Bug’s Life Changing a Plant’s Life:
                   Exploring the Relationship Between Gypsy Moths and Deciduous Broadleaf
                   Trees in Connection to Accumulated Growing Degree Days”. Support of data
                    analyses and visualizations, report generation, and R Shiny app deployment

        Ecological Society of America Workshop: “Access and Work with NEON data                                                                                                              Summer 2019
               Instructor – R for data getting and processing NEON data
        STROBE Science and Technology Center Data Carpentry Workshop                                                                                                                                   Spring 2019

        Ecological Society of America Workshop: “Working with Time Series in R using  NEON Data”                                                                             Summer 2017                                    Instructor – R for data processing and visualization of NEON temperature and plant phenology data 
        US Geological Survey (USGS) Data Carpentry Workshop                                                                                                                                                          Spring 2016
              Instructor - R for data processing and visualization​        
        Ecological Society of America “Big Data in R” Workshop                                                                                                                                                          Summer 2015  
              Instructor – R for spatial data processing and visualization of NEON remote sensing data
        Software Carpentry Unicamp Workshop                                                                                                                                                                                          Summer 2015
              Remote instructor – introduction to R for data processing and visualization
        National Data Integrity Conference (NDIC) Data Carpentry Workshop                                                                                                                                Spring 2015
              Instructor - R for data processing and visualization
        NEON Summer Internship Program                                                                                                                                                                                                  Summer 2014
             Co-mentor for internship project “Exploring vascular plant and carabid beetle diversity across three different ecoclimatic
                      domains using NEON provisional data”. Support of data acquisition, processing, and analysis using R and writing/report generation.
 
      Department of Ecology and Evolutionary Biology; University of Colorado, Boulder                                                               
                   Teaching Assistant                
                       General Biology Lecture TA                                                                                                                                                                                                        Spring 2011
                       Biometry                                                                                                                                                                                                                                             Spring 2010                                           General Biology Clicker Software Manager                                                                                                                                                                         Spring 2009
                        Insect Biology Lab                                                                                                                                                                                        Fall 2008, Fall 2009, Fall 2010
                        Evolutionary Biology Lab                                                                                                                                                                                      Fall 2007, Spring 2008
                        General Biology Lab                                                                                                                                                                                                Fall 2006, Spring 2007
 
                   Guest Lectures
                       Ecology: Climate Impacts on Ecosystems (Co-taught with Liesl Erb)                                                                                                                            Spring 2011
                       Insect Biology: Photoreception in Insects                                                                                                                                                                                      Fall 2010
                       Insect Biology: Chemoreception in Insects                                                                                                                                                                                   Fall 2010
                       Biometry: Model Fitting Using Akaike’s Information Criteria                                                                                                                                        Spring 2010
                       Insect Biology: The Bark Beetles                                                                                                                                                                Fall 2008, Fall 2009, Fall 2011
                       Evolutionary Biology: Coevolution                                                                                                                                                                                           Spring 2008
                       Insect Biology: Coevolution                                                                                                                                                                                                               Fall 2008      
_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
ACADEMIC SERVICE AND OUTREACH
    Peer Review
                   Ecological Indicators                                                 
                         Ecological Applications                                                                                                 PLOS One
                   International Journal of
 Remote Sensing

     Department of Ecology and Evolutionary Biology; University of Colorado, Boulder
                   Colloquium Committee: travel coordinator                                                                                                                                                                 Fall 2012-Fall 2013
                   Graduate Student Mentor (tips and advice for first year graduate students)                                                                                                     Fall 2010-Fall 2013
                   Graduate Computer Committee: Co-chair                                                                                                                                                                                Spring 2012
                   Evolution Outreach Committee: Event organizer and presenter                                                                                                                                      Spring 2008

    Other
                    Lab rep/activity coordinator: Crestview Elementary field trip to CU Boulder                                                                                                            Spring 2012     
Powered by Create your own unique website with customizable templates.